До 2019 года район назывался Сунженским, он создан после разделения единого Сунженского района бывшей Чечено-Ингушской АССР на Сунженский район Чечни и Сунженский район Ингушетии.

Герб и флаг муниципального образования Серноводский муниципальный район утверждены решением Совета депутатов Серноводского района Чеченской республики №22 от 24 сентября 2021 года. Автор герба - А. Грефенштейн. Герб внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 13757. Описание герба:

"В зелёном поле на золотом возвышении, сложенном из глыб - чаша, также золотая, в виде сомкнутых лепестков, с тремя видимыми отверстиями в краях, из которых бьют и падают на глыбы в основании возвышения струи - посередине лазоревая, по краям серебряные; в местах падения струи бурлят, и от них разлетаются капли одного со струёй цвета".

Чаша символизирует известный горячий источник, три струи – 3 районные реки.

По информации В. Маркова