После русско-японской войны (1904-1905) согласно Портсмутскому договору Сахалин был разделен на две части. Южная часть отошла к Японии, составив губернаторство Карафуто. Карафуто делилось на четыре муниципалитета: Тоёхара (Южно-Сахалинск), Маока (Холмск), Сисука (Поронайск), Эсутору (Углегорск). В 1945 году Южный Сахалин возвращен в состав СССР.

Известен значок с проектом герба города, выпущенный еще во времена СССР.

Использовано изображение герба из книги Н.О.Миронова "Каталог современных гербов городов стран содружества на значках", Минск, 1995.; предоставленное В.Марковым (Санкт-Петербург)

Изображение герба Поронайска на программке к 120-летию города. 1989 год.

https://goskatalog.ru/portal/#/collections?id=19707276

Решением Поронайского районного Собрания депутатов № 47 от 12 февраля 1998 года утверждён герб Поронайского района:

"В серебряном поле обращенная влево червленая шхуна на лазоревых разделенных тонкими золотыми каймами волнах".

Герб внесён в Государственный геральдический регистр под №278.

Рисунок эмблемы подготовлен для "Геральдикума" Ю.Калинкиным (г.Долгопрудный)

Автор герба - Николай Григорьевич Иксанов.

В 2006 году муниципальное образование "Поронайский район" было преобразовано в городской округ "Поронайский".

Решением Собрания городского округа "Поронайский" №124 от 5 сентября 2006 года герб бывшего МО "Поронайский район" стал гербом городского округа "Поронайский". Соответствующие изменения были внесены в Положение о гербе городского округа Поронайский. Описание герба в Положении стало таким:

"3. Геральдическое описание и обоснование символики герба городского округа "Поронайский"
3.1. Описание герба городского округа "Поронайский":
Герб представляет собой четырехугольный с закругленными нижними углами, заостренный в оконечности серебряный геральдический щит. В серебряном поле обращенная влево червленная (красная) шхуна на лазоревых (синих, голубых), разделенных тонкими золотыми каймами волнах.
3.2. Обоснование символики герба городского округа "Поронайский.
В гербе городского округа "Поронайский" изображены шхуна и волны. В центре герба в серебряном поле обращенная влево Червленная (красная) шхуна "Восток" на лазоревых, разделенных тонкими золотыми каймами волнах, которая высадила первых основателей поста Тихменево. Белый фон - символ светлого будущего. Лазоревые волны - символ моря, реки Поронай и портового города. Форма щита - историческое значение города, как военного поста и охраны морских границ от японских и американских браконьеров. Золотистая кайма волн - символ солнца, которое каждое утро поднимается из-за моря.

Информация предоставлена В.Л.Марковым (г.Санкт-Петербург)

В 2012 году городской округ "Вахрушев" объединен с городским округом "Поронайск" в единое муниципальное образование - Поронайский городской округ