Герб Попутненского СП утвержден решением 33 сессии II созыва Совета муниципального образования Попутненское сельское поселение Отрадненского района № 170 от 20 января 2012 года и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 7491. Согласно тексту Положения о гербе:

Описание герба:
"В пересечённом зелёном и лазоревом поле вписанный золотой с уширенными концами крест; в центре, поверх всего, червлёный с чёрной сердцевиной на зелёном стебле с листьями зелёными в золоте и золотыми в лазури цветок горицвета, сопровождаемый в золоте: вверху – червлёным с лепестковыми лучами (без лика) солнцем; внизу червлёным фонтаном о четырёх струях".

Обоснование символики герба и флага.
Герб и флаг языком символов и аллегорий отражают исторические, культурные и экономические особенности сельского поселения.
Основана станица Попутная в 1856 году. Первыми поселенцами были казаки Кавказского линейного войска и частично потомки казаков из Малороссии. Казаки станицы Попутной всегда с четью служили по защите родной земли, проявляя мужество и отвагу, что аллегорически и отражено изображением золотого креста с уширенными краями – символа мужества, заслуг, доблести, уважения и почёта.
Золотой цвет символизирует величие, богатство и процветание, прочность, а также говорит о верности, славе и заслугах жителей сельского поселения. Золото также аллегорически указывает на пшеничные поля поселения, которое расположено в южной части Краснодарского края.
Изображение цветка горицвета является единым элементом герба поселений Отрадненского района, аллегорически указывающим на красивейшие места и на наличие редчайшей флоры во всём районе, в том числе и в Попутненском сельском поселении.
Изображение пламенеющего солнца указывает на то, что большинство дней в году в поселении – солнечные. Солнце символ света, тепла, источник жизни на земле.
Изображение фонтана символизирует жизнь. Красный цвет фонтана аллегорически указывает на геотермальные источники, активно осваиваемые в поселении в хозяйственных и лечебных целях. Красный цвет – символ красоты, труда и праздника.
Зеленый цвет – символ плодородия, гор и лесов, природного изобилия, спокойствия, здоровья и вечного обновления, и аллегорически указывает на растениеводство и животноводство развиваемое в поселении.
Лазоревый (синий, голубой) цвет символизирует безупречность, добродетели, чистое небо, волю, веру, честь, искренность, возвышенные устремления, а также аллегорически указывает на реки Уруп и Бей-Мурза Чехрак, протекающие через поселение.
Автор герба, изображение и обоснование символики: В. Нагаевский (Тихорецк).

Материалы предоставлены М.Шаруновым