В конце 1990-х-начале 2000-х годов появилась первая эмблема района. Она, в частности. использовалась в заголовке районной газеты "Маяк Кулунды". Решением Территориального Совета депутатов Купинского района от 17 июня 2003 года утвержден герб района: "... геральдический щит, в центре которого изображен колос - символ зернового производства - основы экономики района (в центре второго колоска левой стороны обозначен точкой райцентр), с правой и левой стороны колоса изображены символы животноводческой отрасли, обрамляющий их круг в виде шестерни отображает промышленность района, контуром изображена карта района, все это показано на голубом фоне, символизирующем наличие малых озер и озера Чаны. Зеленый фон обозначает степную зону района".

Этот герб получил отрицательную оценку геральдической комиссии при главе администрации Новосибирской области. Было составлено несколько проектов нового герба. По предложению зав.районным архивом Е.В.Иванинской в основу герба положен сюжет иконы "Неопалимая купина".

Источник - "Официальные символы Новосибирской области и муниципальных образований, входящих в ее состав".

Герб Купинского района утверждён Решением Совета депутатов № 92 от 21 февраля 2006 года:

"В золотом поле с лазоревой оконечностью, обремененной серебряной щукой, червленый четырехконечный крест с концами в виде языков пламени, между которыми размещено по три зеленых березовых листа".

Герб района внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 2371.

Использованы материалы сайта Сибирской геральдической коллегии; рисунок герба для "Геральдикума" подготовлен Ю.Калинкиным (г.Долгопрудный)