Десногорск получил статус города в 1989 году.

Эмблема Десногорска с сувенирных значков: В верхней части червлено-лазоревого пересеченного щита пушка с сидящей на ней райской птицей - все золото; в нижней - три золотые орбиты электронов, заполненные серебром, с золотыми буквами "САЭ" в виде круга в центре.

Рисунок эмблемы подготовлен для "Геральдикума" Ю.Калинкиным (г.Долгопрудный)

По инициативе городского комитета молодежи был проведен конкурс на лучший эскиз герба. 23 декабря 1992 года сессией городского Совета народных депутатов герб города был утвержден.

На голубом поле щита изображены три волны в цветах государственного флага России. На волны наложено изображение стилизованного атома, в центре атома на зеленом фоне изображена птица Феникс. В верхней части щита на красной ленте название города золотыми буквами.

Волны символизируют Десногорское водохранилище, атом - вклад города в атомную энергетику, а феникс - возрождение.

Авторы герба: Е. Котухов, Е. Кулаков и В. Морозов.

Использованы материалы и изображение герба с официального информационного сайта Администрации Десногорска

Со временем герб изменился. Согласно Положению о гербе города Десногорск, утверждённому решениюм №25 Десногорского городского Совета от 1 июня 2004 года:

"2. Геральдическое описание герба
2.1. Изображение герба расположено на щите, с соотношением сторон 9 единиц по вертикали и 8 единиц по горизонтали. В верхних углах щита имеются вырезы в четверть круга с радиусом 1 единица. Поле щита окрашено в голубой цвет и имеет двойной контур, темно-синий внешний и золотой внутренний. На щите центрально расположена эмблема города, включающая в себя райскую птицу - символ города Смоленска и Смоленской области и возрождения, вписанную в знак атомной энергетики - кольца вращающегося атома. Птица и кольца - золотого цвета на темно-синем фоне. Поле щита горизонтально пересечено белыми и темно-синими волнами - символ самого крупного в Смоленской области Десногорского водохранилища. В верхней части щита расположена темно-синяя лента с надписью золотом "Десногорск" Смоленской области".

Материалы сайта города Десногорска

Окончательно герб Десногорска утвержден решением Десногорского городского Совета от 28 октября 2009 года №106 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №5763. Описание герба:

"В пересеченном серебряном и лазоревом поле - вверху выщербленный, внизу чешуйчатый пояс, троекратно просеченный лазурью и серебром, и поверх всего - золотой, заполненный червленью знак атома, вместо ядра имеющий золотого обращенного вправо и обернувшегося влево голубя, вписанного в золотое же кольцо".

Обоснование символики герба города Десногорска.
Десногорск - город, который возник при строительстве Смоленской АЭС как посёлок энергетиков. Главная фигура герба - знак атома, отражает особенность становления города и его специфику. Сочетание красного и золотого цвета символизируют свет и тепло, которые даёт людям энергия станции. Голубь - символ мира, спокойствия, гармонии подчеркивает мирное служение атома человеку.
Город расположен на живописных берегах Десногорского водохранилища, самого крупного в области. В гербе водохранилище отражено волнистыми поясами и переменой цвета, геральдическим приемом, аллегорически отражающим верхний и нижний бьефы, создаваемые плотиной.
Золото - символ богатства, уважения, стабильности, интеллекта, энергии.
Серебро - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Голубой - символ чести, безупречности, преданности, истины.
Красный цвет - символ труда, силы, мужества, красоты и праздника.
Герб разработан на основе ранее существовавшего герба, утвержденного решением Десногорского городского Совета народных депутатов от 23.12.1992г.
Авторская группа:
идея герба: Евгений Котухов, Владимир Морозов, Евгений Кулаков (все Десногорск);
геральдическая доработка: Константин Мочёнов (Химки);
обоснование символики: Кирилл Переходенко (Конаково);
компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (Москва)".

Использованы материалы сайта Союза геральдистов России