Село Антипаюта основано в 1944 году. В 2004 году село Антипаюта получило статус муниципального образования - сельского поселения.

Герб села Антипаюта утверждён Решением Собрания депутатов муниципального образования село Антипаюта от 4 марта 2010 года №05. Описание герба:

"В лазоревом поле над выщербленной узкой оконечностью, обремененной серебряным осетром, на земле в виде трех холмов того же металла – идущий (иноходью, выступающий вперед левой передней ногой, а правую поднимающий) северный олень с золотыми копытами и рогами, сопровожденный вверху по углам – справа серебряной звездой о четырех больших и четырех малых лучах попеременно, слева – золотым концом ольховой ветви с листьями и шишками".

По сообщению Б.Вольфова со ссылкой на http://www.antipauta.tasu.ru/