Самоуправление Шакяйского района входит в Мариямпольский уезд. Административный центр - г.Шакяй (Šakiai). В Российской империи город именовался Шаки и входил в Cувалкскую губернию Царства Польского.

В состав самоуправления Шакяйского района входят 3 города, 8 местечек и 533 деревни, объединенные в 14 староств: Барздайское (Barzdų seniūnija), Гелгаудишское (Gelgaudiškio seniūnija), Гришкабудисское (Griškabūdžio seniūnija), Кидуляйское (Kidulių seniūnija), Крюкяйское (Kriūkų seniūnija), Кудиркос-Науместисское (Kudirkos Naumiesčio seniūnija), Лекечяйское (Lekėčių seniūnija), Лукшяйское (Lukšių seniūnija), Плокщяйское (Plokščių seniūnija), Синтаутяйское (Sintautų seniūnija), Славикяйское (Slavikų seniūnija), Сударгасское (Sudargo seniūnija), Шакяйское (Šakių seniūnija) и Жвиргждайчяйское (Žvirgždaičių seniūnija).

В 1876 году составлен проект герба города Шаки: "В серебряном щите на зеленой траве такой же льняной колос между 6 черными кабаньими клыками, выходящими по 3 с каждой стороны щита". Щит венчала стенчатая корона, окружали золотые колосья, соединенные Александровской лентой.

Материалы геральдического архива В.Маркова (г.Санкт-Петербург); рисунок подготовлен для "Геральдикума" Ю.Калинкиным

В советское время герб Шакяя был таким: "Герб представляет собой рассеченный щит с пониженным поясом зеленого цвета. Правая половина поля щита красная, левая – серебро. В верхней части правой половины щита в красном поле 2 перекрещенных серебряных снопа льна. В левой в серебряном поле 6 черных языков пламени".

Материалы геральдического архива В.Маркова (г.Санкт-Петербург)

Современный герб Шакяя утвержден 26 января 1998 года указом президента Литовской Республики №1497 по проекту художницы Астриды Жилинскайте (Astrida Žilinskaitė). Он повторяет вариант, разработанный еще в советское время.

Щит рассечен на красное и серебряное поля, поверх всего зеленый пониженный пояс. Над ним в первом поле изображены два скрещенных серебряных снопа льна, во втором поле шесть чёрных кабаньих клыков, выходящие по три из сторон поля.

Рисунок прислан С.Бубновым

Многие источники отмечают, что красный, белый и зелёный цвета шакяйского герба происходят от цветов флага Малой Литвы, но достоверных сведений о том, что в 1795-1815 гг., когда часть территории современного самоуправления Шакяйского района входила в состав Пруссии, уже существовал и использовался флаг Малой Литвы, не имеется.